Sampai saat ini pengaruh teologis Wesley tetap memegang peranan utama dalam kelompok-kelompok Metodis maupun yang mewarisi tradisi Metodis di seluruh dunia; dengan Gereja Metodis Bersatu, Gereja Metodis Britania Raya, dan Gereja Episkopal Metodis Afrika sebagai kelompok-kelompok terbesar. Ajaran-ajaran Wesleyan juga berfungsi sebagai dasar bagi apa yang disebut gerakan kesucian/kekudusan, yang mencakup denominasi-denominasi seperti Wesleyan Church, Free Methodist Church, Church of the Nazarene, Christian and Missionary Alliance, Church of God (Anderson, Indiana), dan sejumlah kelompok yang lebih kecil, serta menghasilkan cabang-cabang seperti Pentakostalisme dan bagian-bagian dari Gerakan Karismatik.[105] Seruan Wesley akan kekudusan pribadi dan sosial senantiasa menantang umat Kristian yang berupaya untuk mengenali dan memahami apa artinya berpartisipasi dalam Kerajaan Tuhan. Selain itu, beliau dianggap memperbaiki paham Arminianisme dengan suatu penekanan injili yang kuat pada doktrin Reformed pembenaran oleh iman.

Wesley tercantum dalam Kalender Orang Kudus Gereja Evangelis Lutheran di Amerika untuk diperingati setiap tanggal 2 Mac bersama Charles saudaranya. Wesley bersaudara juga tercantum dalam Kalender Orang Kudus Gereja Episkopal untuk diperingati setiap tanggal 3 Mac, dan tanggal 24 Mei dalam kalender Anglikan.

Pada 2002, Wesley dicantumkan pada nomor 50 dalam 100 Greatest Britons susunan BBC, yang diambil dari suatu jajak pendapat publik Britania.[3][106]

Rumah dan kapel Wesley, yang dibangunnya pada 1778 di City Road di London, masih utuh hingga sekarang. Kapel tersebut mengakomodasi suatu jemaat yang berkembang dengan adanya ibadah-ibadah reguler, serta Museum Metodisme di ruang bawah tanah.

Banyak sekolah, perguruan tinggi, rumah sakit, dan institusi lainnya yang menggunakan nama Wesley; selain itu, banyak pula yang menggunakan nama Metodisme. Pada 1831, Universitas Wesleyan di Middletown, Connecticut, menjadi institusi pendidikan tinggi pertama di Amerika Syarikat yang menggunakan nama Wesley. Universitas yang sekarang merupakan institusi sekuler itu didirikan sebagai perguruan tinggi Metodis khusus lelaki. Di kemudian hari, sekitar 20 perguruan tinggi atau universiti yang tidak terkait di Amerika Syarikat turut menggunakan namanya.

Peninggalan Wesley juga terlestarikan dalam Sekolah Kingswood, yang didirikannya pada 1748 untuk mendidik anak-anak dari para pengkhutbah Metodis yang mengalami peningkatan jumlah. Salah satu dari empat rumah pembentukan di Gereja St Marylebone dari Sekolah Inggris, London, juga menggunakan nama John Wesley.

• "Remember John Wesley", Wroot, dekat Epworth.
• Patung Wesley di luar Wesley Church, Melbourne, Australia.
• Panel peraga di Gwennap Pit, Cornwall, Inggris.
• Jendela kaca patri di Lake Junaluska, North Carolina.